Dr. Cristian Gallardo Escárate INCAR Deputy Director and Principal investigator in research line " Genome Aquaculture Technology
INCAR Deputy Director and Principal investigator in research line " Genome Aquaculture Technology
Biografía
Dr. Gallardo-Escárate is a Marine Biologist from Universidad Católica del Norte and Ph.D. in Aquaculture from CICESE, Baja California, Mexico (2005). In 2006, he joined to Universidad de Concepción, leading the Aquaculture Biotechnology and Genomics Laboratory, specializing in genomic studies of marine organisms. Since 2012, Dr. Gallardo-Escárate has been the INCAR Deputy Director. Dr. Gallardo-Escárate has published over 170 scientific papers in peer-reviewed journals and has made more than 250 presentations at scientific meetings around the world. Dr. Gallardo-Escárate has also served and currently serves on evaluation committees for European projects in the field of marine biotechnology.
Títulos Profesionales
Doctorado en Ciencias, Programa Acuicultura y Biotecnología Marina. Centro de Investigaciones
Científicas y de Educación Superior de Ensenada, Baja California, México.
Biólogo Marino, Universidad Católica del Norte. Chile.
Licenciatura en Ciencias del Mar, Universidad Católica del Norte, Chile.
Títulos y Grados Académicos
Doctorado en Ciencias, Programa Acuicultura y Biotecnología Marina. Centro de Investigaciones Científicas y de Educación Superior de Ensenada, Baja California, México.
Intereses de Investigación
1. Montes R., Quiñones R.A., Gallardo-Escarate C. 2019. Identification and quantification of temporal variability scales relevant to abundance of Caligus rogercesseyi for the regios of Los Lagos and Aysén. XXXIX Congreso Nacional de Ciencias del Mar, 27-31 de mayo, Iquique, Chile.
2. Casuso A., Gallardo-Escárate C. 2019. Identification of two candidates for vaccines against Caligus rogercresseyi: An approximation based on reverse vaccinology Latin American & Caribbean Aquaculture 19 (LAQUA 2019). 19-22 de noviembre, San José, Costa Rica.
3. Casuso A., Gallardo-Escárate C. 2019. Identification of transferrin as potential vaccine candidate against sea lice: A reverse vaccinology approach. Latin American & Caribbean Aquaculture 19 (LAQUA 2019). 19-22 de noviembre, San José, Costa Rica.
4. Montes R., Quiñones R.A., Gallardo-Escárate C. 2019. Early alert indicators for the management of caligidosis in chilean salmoniculture. Latin American & Caribbean Aquaculture 19 (LAQUA 2019). 19-22 de noviembre, San José, Costa Rica.
5. Núñez-Acuña G., Sáez-Vera C., Sanhueza-Guevara S., Fernández C., Gallardo-Escárate C. 2019. Pesticide drugs used against sea lice cause transcriptome changes in the early stages of the non-target species Choromytilus chorus. 3rd International Conference on Fish & Shellfish Immunology. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España
6. Jessen G.L., Inostroza P.A., Quiñones R.A., Gallardo-Escárate C., Zhang X., Krauss M., Brack W., Backhaus T. 2019. Microbial community responses in a chemically stressed freshwater ecosystem: do chemical mixtures play a role? ISME Latin America. 11-13 de septiembre, Valparaiso, Chile.
7. Gallardo C., Valenzuela V., Núñez G., Carrera C., Gonçalves A.T., Valenzuela D., Benavente B., Roberts S. 2019. Cathcing the complexity of salmon-louse interactions. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
8. Casuso A., Núñez-Acuña G., Valenzuela-Muñoz V., Leal Y., Gallardo-Escárate C. 2019. Identification of peritrophins as potential vaccine candidates against sea lice: a reverse vaccinology approach 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
9. Sáez-Vera C., Núñez-G., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2019. Hydrogen peroxide treatment modulates the immune and detoxification responses in the sea louse Caligus rogercresseyi 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
10. Leal Y., Valenzuela-Muñoz V., Benavente B., Carrera-Naipil C., Casuso A., Gallardo-Escárate C. 2019. Role of sea lice secretome in host-parasite interaction: immune modulation of SHK-1 cells exposed to Caligus rogercresseyi secretome. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
11. Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2019. Genomic for the understanding of the host-pathogen interaction: the case of Atlantic salmon and Piscirikettsia salmonis. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
12. Núñez-Acuña G., Sáez-Vera C., Sanhueza-Guevara S., Fernandez C., Gallardo-Escárate C. 2019. Pesticide drugs used against sea lice cause transcriptome changes in the early stages of the non-target species Choromytilus chorus. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
13. Núñez-Acuña G., Valenzuela-Muñoz V., Sáez-Vera C., Gallardo-Escárate C. 2019. Temperature drives the immune response in Atlantic salmon infected with sea lice: novel insights through transcriptome sequencing analyses. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
14. Valenzuela-V. Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2019. Iron overload alters the immune response in Atlantic salmon and increases the susceptibility to piscirickettsia salmonis infection. 3rd International Symposium of Fish and hellfish Immunology – ISFSI2019. 16-20 de junio, Las Palmas de Gran Canarias, España.
15. Gonçalves A.T., Collipal-Matamala R., Gallardo-Escárate C. 2019. Probiotic yeast protects Atlantic salmon against Piscirickettsia salmonis by empowering crosstalk between microbiota and fish via microRNAs modulation 19th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish. . 9-12 de septiembre, Porto, Portugal.
16. Gonçalves A.T., Collipal-Matamala R., Gallardo-Escárate C. 2019. Salmon intestinal nutrimiromics: probiotic yeast regulates the interplay of miRNome, metagenome and transcriptome in the gut increasing homeostasis and health under stress. International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019. 17-20 de noviembre, Edimburgh, Escocia.
17. Núñez-Acuña G., Valenzuela-Muñoz V., Núñez-Acuña P., Gallardo-Escárate A., Gallardo-Escárate C. 2019. Environmental Conditions Modulate the Non-Coding Transcriptome Responses in Atlantic Salmon Against Sea Lice Infection: Novel Key Molecular Regulators? International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019. 17-20 de noviembre, Edimburgh, Escocia.
18. Valenzuela-Muñoz V., Váldes J.A., Gallardo-Escárate C. 2019. Beyond the transcriptome modulation during Atlantic salmon smoltification process: role of non-coding RNAs in seawater adaptation. International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019. 17-20 de noviembre, Edimburgh, Escocia.
19. Trigg S., Gallardo-Escárate C., Roberts S. 2019. Enviromental influence on the salmon epigenome during sea lice infestation. International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019. 17-20 de noviembre, Edimburgh, Escocia.
20. Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2019. Genomic for the understanding of the host-pathogen interaction: the case of Atlantic salmon and Piscirikettsia salmonis International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019 17-20 de noviembre Edimburgh, Escocia.
21. Gallardo-Escárate C., Valenzuela-Muñoz V., Nuñez-Acuña G., Gonçalves A.T., Valenzuela-Miranda D., Roberts S. 2019. The Dark matter of the salmon genomie: non-coding RNAs as key playes in the host-parasite interactions. International Conference of Integrative Salmonid Biology ICISB2019 17-20 de noviembre, Edimburgh, Escocia.
22. Valenzuela-Muñoz V., Benavente B.P., Gallardo-Escárate C. 2019. Bantam miRNA expressed in the sea louse modulates the fish immune response. Molecular Biosystems Conference on Eukaryotic Gene Regulation and Functional Genomics. 30 sept-04 octubre Puerto Varas, Chile
23. Núñez-Acuña G., Sáez-Vera C., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2019. Descifrando la sensibilidad farmacológica de Caligus rogercresseyi a nivel molecular: implicancias de la interacción entre RNAs codificantes y no- codificantes. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas, Chile.
24. Valenzuela-Muñoz V., Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate A., Benavente B. P., Sáez-Vera C., Valenzuela-Miranda D., Gonçalves A. T., Gallardo-Escárate C. 2019. Efecto t/s sobre la modulación transcriptómica del salmón del Atlantico y Caligus rogercresseyi durante el proceso de infestación. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
25. Morales-Rivera F., Casuso A., Gallardo-Escárate C. 2019. Evaluación de la actividad antimicrobiana del dominio von willebrand factor de la vitelogenina I de Caligus rogercresseyi. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
26. Casuso A., Valenzuela Muñoz V., Gallardo Escárate C. 2019. Dentificación in silico del potencial antigénico de genes asociados a la modulación de hierro para el desarrollo de vacunas contra la caligidosis. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
27. Leal Y., Benavente B., Carrera-Naipil C., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2019. Modulación de la respuesta inmune en línea celular shk-1 expuesta a proteínas del secretoma de Caligus rogercresseyi. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
28. Sáez-Vera C., Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate C. 2019. Bioensayo tiempo de respuesta asociado con marcadores moleculares: un nuevo método para evaluar la sensibilidad del piojo de mar Caligus rogercresseyi al antiparasitario azametifos. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
29. Carrera-Naipil C., Gallardo-Escarate C. 2019. Regulación post transcripcional de Vitelogenina I de Caligus rogercresseyi mediado por mir-996. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
30. Gonçalves A.T., Collipal R., Valenzuela V., Nuñez G., Valenzuela D., Gallardo C. 2019. Caracterización de la microbiota asociada a Caligus rogercresseyi de distintas regiones acuícolas de Chile través de secuenciación de tercera generación. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
31. Benavente B.P., Carrera-Naipil C., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2019. Modulación de respuesta inmune y homeostasis de hierro en el salmón del atlántico mediante ferritina recombinante de Caligus rogercresseyi. I Congreso Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la Salmonicultura chilena, 13 de diciembre, Puerto Varas,
32. Núñez-Acuña P., Núñez-Acuña G., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate A., Gallardo-Escárate C. 2019. Efecto de la temperatura y salinidad sobre el ciclo de vida de Caligus rogercresseyi. XXXIX Congreso de Ciencias del Mar, Recuperación y protección de la biodiversidad en un escenario de cambio global. 27-31 de mayo, Iquique, Chile.
33. Núñez-Acuña P., Gallardo-Escárate A., Valenzuela-Muñoz V., Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate C. 2019. Efecto de la temperatura y la salinidad sobre la morfología de Caligus rogercresseyi durante su ciclo de vida I Congreso “Impactos y estrategias de prevención y control de la Caligidosis en la SalmoniculturacChilena. 13 de diciembre, Puerto Varas, Chile.
34. Arriagada G., Marín S., Lara M.,Gallardo A., Gallardo-Escárate C. 2019. Identification of success factors for antiparasitic treatments against the salmon louse Caligus rogercresseyi in Chile through an expert panel Aquaculture Europe 2019. 7-10 de octubre, Berlín, Alemania.
35. Gallardo-Escárate C., Valenzuela-Muñoz V., Núñez-Acuña G., Valenzuela-Miranda D. 2019. Reverse Vaccinology: Functional Genomics Applied to the Development of Vaccines against Caligus rogercresseyi" XXVII Plant & Animal Genome. 12-16 de enero, San Diego, USA
36. Gallardo-Escárate C., Figueras A., Novoa B. 2019. The dark matter of the mussel’s genome: long non-coding RNAs as key players in Mytilus. 3rd International Symposium on the Advances in Marine Mussel Research. 26-28 de agosto, Chioggia, Italia.
37. Gonçalves A.T., Gallardo-Escárate C. 2018. Empowering health and defenses in Atlantic salmon with functional supplements: a comparative analysis between pre- and probiotic effects on intestinal function, metabolism and immune response 18th International Symposium of Fish Nutrition and Feeding. 3-7 de junio, Las Palmas de gran canaria, España.
38. Gonçalves A.T., Sanchez R., Leyton P., Gallardo C., Collipal R., Herrera H., Cabezas R., Saez P. 2018. The integrative response of Atlantic salmon to fish meal replacement: from nutrigenomics to physiology. 18th International Symposium of Fish Nutrition and Feeding. 3-7 de junio, Las Palmas de gran canaria, España.
39. Collipal R., Gallardo C., Gonçalves A.T. 2018. Immunomodulation by functional diets in intestine, liver and kidney of Salmo salar fish challenged with a bacterial pathogen. Latin American and Caribbean Aquaculture - LACQUA2018. 22-26 de octubre, Bogotá, Colombia.
40. Collipal R., Cabezas R., Gonçalves A.T., Sanchez R., Herrera H., Gallardo C., Leyton P., Perez V. 2018. Molecular and histological output of a fortified functional diet designed to instant boost growth and performance in Atlantic salmon. Latin American and Caribbean Aquaculture - LACQUA2018. 22-26 de octubre, Bogotá, Colombia.
41. Sánchez R., Gonçalves A.T., Sáez P., Leyton T., Collipal R., Gallardo., C., Cabezas R., Herrera H. 2018. Evaluation of diets without inclusion of fishmeal in Atlantic salmon Salmo salar: advancing in the sustainability and efficiency of production. Latin American and Caribbean Aquaculture - LACQUA2018. 22-26 de octubre, Bogotá, Colombia.
42. Núñez-Acuña G., Gallardo-Escarate C., Fields D., Shema S., Berit A., Ormazabal I., Browman H. 2018. The Atlantic salmon (Salmo salar) antimicrobial peptide cathelicidin-2 is a molecular host recognition cue for the salmon louse (Lepeophtheirus salmonis). 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
43. Arriagada G., Lara M., Gallardo A., Artacho P., Ibarra R., Gallardo-Escarate C. 2018. Temporal and spatio-temporal patterns of caligidosis and piscirickettsiosis co-occurrence in salmon farms in Chile. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
44. Ilardi P., Fuentealba P., Rivera-Bohle J., Madrid E., Valenzuela-Muñoz, V., Gallardo-Escárate C., Gajardo–Córdova J. 2018. Efficacy of recombinant vaccines against the sea louse Caligus rogercresseyi infecting Atlantic salmon (Salmo salar). 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
45. Núñez-Acuña G., Arriagada G., Valenzuela-Muñoz V., Saez C., Gallardo-Escárate C. 2018. Time-to-response toxicity analysis using molecular biomarkers as alternative bioassay for delousing drug sensitivity. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
46. Valenzuela-Muñoz V., Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2018. Salmon non-coding RNAs repertoire and their modulation during C. rogercresseyi infestation. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
47. Gallardo-Escárate C., Valenzuela-Muñoz V., Nuñez-Acuaña G., Valenzuela-Miranda D. 2018. Reverse vaccinology applied to the development of new vaccines against Caligus rogercresseyi. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
48. Leal Y., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2018. Immune modulation of Caligus rogercresseyi secretome: An in vitro approach using SHK1 cell line. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
49. Casuso A., Valenzuela-Muño, V, Gallardo-Escárate C. 2018. Antimicrobial activity evaluation of the Von Willebrand factor domain of two vitellogenins of Caligus rogercressey. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
50. Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate A. Gallardo-Escárate C. 2018. Effect of temperature and salinity on the morphology and allometry in early stages of Caligus rogercresseyi. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
51. Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate A., Garcés F., Bonfatti J., Aaen S., French M., Gallardo-Escárate C. 2018. More than bubbles: transcriptome and in vivo evaluation of Caligus rogercresseyi and Atlantic Salmon exposed to hydrogen peroxide (PARAMOVE®). 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
52. Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate C., Skiftesvik A.B., Fields D., Browman H.I. 2018. Silencing of ionotropic receptor 25a decreases chemosensory activity of the salmon louse Lepeophtheirus salmonis during the infective. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
53. Núñez-Acuña G., Gallardo-Escárate C. 2018. Characterization of the salmon louse Lepeophtheirus salmonis mirnome: sex-biased differences related to the coding and non-coding RNA interplay. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
54. Núñez-Acuña G., Valenzuela-Muñoz V., Arriagada G., Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2018. Disentangling sea lice responses to antiparisitic drugs: emerging role from non-coding RNAs. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
55. Arriagada G., Valenzuela V., Arriagada A.M., Brossard M., Gallardo A., Lara M., Gallardo-Escárate C. 2018. First report of the sea louse Caligus rogercresseyi found in farmed Atlantic salmon in the Magallanes region (south 49º16’ S), Chile. 12TH Iinternational Sea Lice Conference. 04-08 de noviembre, Punta Arenas, Chile.
56. Gallardo C. 2018. Validation of bioassays for phenotypic and genomic determination of Caligus antiparasitic resistance X Research sessions on salmon farming. 25 de mayo, Puerto Varas, Chile.
57. Farlora R., Zuloaga R., Donoso J., Nuñez-Acuña G., Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escarate C., Aedo J., Meneses C., Valdés J., Molina A. 2017. Transcriptomic modulation of long non-coding RNAs associated with stress response and growth in the skeletal muscle of the fine flounder (Paralichthys adspersus). XL Reunión Annual de la Sociedad Chilena de bioquímica y Biología Molecular, 26-29 de septiembre, Puerto Varas, Chile.
58. Gonçalves AT., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2017. Uncovering the effects of chronic stress on intestinal mucosa homeostasis and the protective effects of functional diets by transcriptome RNA-seq in Oncorhynchus mykiss. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
59. Arriagada G., Gallardo-Escárate C., Marín, S. 2017. Evaluating the spatial component of synchronized antiparasitic treatments on the abundance of the sea lice caligus rogercresseyi in Chile. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
60. Détrée C., Gallardo-Escarate C. 2017. Disruptive effects of current and futuristic concentration microplastics on mytilus chilensis’ transcriptome. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
61. Gallardo-Escárate C., Valenzuela-Muñoz V., Nuñez-Acuña G., Valenzuela-Miranda D. 2017. Functional Genomics Applied to the Development of new Vaccines Against the sea louse Caligus rogercresseyi. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
62. Gallardo-Escárate C., Valenzuela-Muñoz V., Boltaña S., Nuñez-Acuña G., Valenzuela-Miranda D. 2017. The Caligus rogercresseyi MIRNOME: Discovery and transcriptome profiling during the sea lice ontogeny. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
63. Gonçalves A., Nuñez-Acuñ G., Detrée C., Gallardo-Escárate C. 2017. Functional diets modulate LNCRNA-Coding RNAS and Gene interaction in the intestine of Rainbow Throut Oncorhynchus mykis. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
64. Valenzuela-Miranda D., Valenzuela-Muñoz V., Gallardo-Escárate C. 2017. Uncovering the role of non-coding RNAS in Atlantic salmon during the infection with the intracellular bacterium Piscirickettsia salmonis. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
65. Valenzuela-Muñoz V., Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2017. Comparative transcriptome analysis of long non-coding RNAs (lncRNAs) between two salmon species and their role during sea lice infestation. Aquaculture Europe 2017, 17-20 de octubre, Dubrovnik, Croacia.
66. Gallardo-Escárate C.,Valenzuela-Muñoz V., Nuñez-Acuña G., Valenzuela -Miranda, D., Gonçalves, AT. 2017. Functional genomics applied to the development of new vaccines against the sea louse Caligus rogercresseyi. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
67. Valenzuela-Miranda D., Tarifeño E., Gallardo-Escárate C. 2017. Dual RNA-Seq approach reveals metabolic dependency of the intracellular bacterium Piscirickettsia salmonis on the Atlantic salmon (Salmo salar) amino acids. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
68. Núñez-Acuña G., Browman H., Skiftesvik AM., Fields D., Gallardo-Escárate C. 2017. Key cell-receptors and kairomones involved in host-recognition mechanisms in sea lice Lepeophtheirus salmonis inferred from RNAi experiments. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
69. Valenzuela-Muñoz V., Novoa B., Figueras A., Gallardo-Escárate C. 2017. Modulation of Atlantic salmon miRNome response to sea louse. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
70. Gonçalves AT., Ruano M., Gallardo-Escárate C. 2017. The transcriptional modulation of rainbow trout’s iron regulatory genes by probiotic yeast during bacterial infection. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
71. Tarifeño-Saldivia E., Valenzuela-Miranda D., Gallardo-Escárate C. 2017. Transcriptional cytoskeleton reorganization of Atlantic salmon infected with the intracellular bacterium Piscirickettsia salmonis suggests modulation through non-coding RNAs . Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
72. Valenzuela-Muñoz V., Novoa B., Figueras A., Gallardo-Escárate C. 2017. Zebrafish lncRNA modulation during viral infestation: Differences between wild type and RAG strains. Biotecnology Habana 2017, 03-06 de diciembre, Varadero, Cuba.
73. Gonçalves, A.T., Karkling-Meza, A., Lehnebach-Miranda, G., Herrera-Araya, H., Boltaña-Harms, S., Gallardo-Escárate, C. The hepatoprotection of a thistle plant extract as an infeed ingredient in salmonids: a multivariate in vitro and in vivo Aquaculture Europe 2016. Edinburgh, Scotland, 20-23 September 2016.
74. Goncalves, A.T., Gallardo-Escárate, C. Immunomodulation of Oncorhynchus mykiss intestinal mucosa by functional feeds: a high-throughput sequencing approach. Aquaculture Europe 2016. Edinburgh, Scotland, 20-23 September 2016.
75. Valenzuela-Miranda, D., Gallardo-Escárate, C. Long non-coding RNAs: unexplored players during drug metabolism in the sea lice Caligus rogercresseyi. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
76. Valenzuela-Muñoz, V., Núñez-Acuña, G., Valenzuela-Miranda, D., Gonçalves, A.T., Boltaña, S., Gallardo-Escárate, C. Uncovering species-specific iron regulation patterns in Atlantic and Coho salmon during the infection with the sea louse Caligus rogercresseyi. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
77. Núñez-Acuña, G., Pino-Marambio, J., Wadsworth, S., Valenzuela-Muñoz, V., Boltaña, S., Valenzuela-Miranda, D. Gonçalves, A.T., Gallardo-Escárate, C., Discovering of key molecules involved in host recognition mechanisms in the salmon louse Caligus rogercresseyi. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
78. Farlora, R., Valdebenito-Aguayo, F., Valenzuela-Muñoz, V., Gallardo-Escárate, C., Assessment of hydrogen peroxide treatment on the expression of reproduction-related genes in the sea lice Caligus rogercresseyi. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
79. Gallardo-Escárate, C., Valenzuela-Muñoz, V., Núñez-Acuña, G., Valenzuela-Miranda, D., Gonçalves, A.T., Boltaña, S. The emerging role of non-coding RNAs in the host/sea lice interaction. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
80. Valenzuela-Muñoz, V., Núñez-Acuña, G., Valenzuela-Miranda, D., Gonçalves, A.T., Boltaña, S., Gallardo-Escárate, C. MicroRNA expression profiles in Atlantic salmon infected with Caligus rogercresseyi. The 11th International Sea Lice Conference. Westport, Ireland. 26-28 September 2016.
81. Valenzuela-Miranda, D., Del Río-Portilla, MA., Gallardo-Escárate, C. 05-10 October 2015. Growth-related transcriptome of the red abalone, Haliotis rufescens Swainson, 1822. IAS2015, 9th International Abalone Symposium, Yeosu, Korea.
82. Valenzuela-Miranda, D., Segovia, C., Valderrama, K., Almarza, O., Gallardo-Escárate, C., Santander, J. 23 – 26 August 2015. Molecular mechanisms orchestrating iron uptake in Piscirickettsia salmonis. Aquaculture 2015. Le Corum, Montpellier, France.
83. Valenzuela, D., Boltaña, S., Gallardo-Escárate, C. 30th March 2015. RNA-seq analysis unravels the mechanisms of ISAV-induced a divergent tissue regulation in Atlantic salmon (Salmo salar). 13th International Society of Developmental & Comparative Immunology, Murcia, Spain.
84. Aedo, J., Fuentes, E., Gallardo-Escárate, C., Molina, A., Valdes, J.A. Analysis of handling stress-responsive transcriptome of red cusk-eel (Genypterus Chilensis). 27th Conference of European Comparative Endocrinologists. 25th to 29th August 2014. Rennes, France.
85. González, P., Estrada, J., Gallardo, C., Valdes, J., Meneses, C., Molina, A. Microsatellite identification for genetic variability analysis in Red cusk-eel (Genypterus chilensis). XXXVII Annual Meeting Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile. September 30th to October 04th 2014. Puerto Varas, Chile.
86. Aedo, E., Aballai, V.,Fuentes, E.,Gallardo-Escarate, C.,Molina, A.,Valdés, J. Transcriptomic analysis of handling stress response of the red cusk eel (Genypterus chilensis) skeletal muscle. XXXVII Annual Meeting Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile. September 30th to October 04th 2014. Puerto Varas, Chile.
87. Valenzuela-Muñoz, V., G. Núñez-Acuña & C. Gallardo-Escárate. “RNA-Seq analysis evidences a multiple gene response in Caligus rogercresseyi exposed to the organophosphate azamethiphos (BAYER). Sea Lice 2014. August 31st to September 5th. Portland, Maine, USA.
88. Chávez-Mardones, J. & C. Gallardo-Escárate. “Deltamethrin (Alphamax) reverals modulation of genes related to oxidative stress in the ectoparasite Caligus rogercresseyi: Implication on delousing drug effectiveness”. Sea Lice 2014. August 31st to September 5th. Portland, Maine, USA.
89. Maldonado-Aguayo, V. & C. Gallardo-Escárate. “Increasing transcriptome response of SERPINs during the ontogenetic stages in the salmon louse Caligus rogercresseyi”. Sea Lice 2014. August 31st to September 5th. Portland, Maine, USA.
90. Valenzuela-Muñoz, V., G. Núñez-Acuña, A. Peña & C. Gallardo-Escárate. “ Identification of candidate genes with response to delousing drugs by transcriptoe mining in the salmon louse Caligus rogercresseyi”. Sea Lice 2014. August 31st to September 5th. Portland, Maine, USA.
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Tesis Guiadas
Tesis de Postgrado
1. Fredy Vera Bizama. Identificación y evaluación de genes asociados al sistema profenoloxidasa de Caligus rogercresseyi y su respuesta transcriptómica frente a los antiparasitarios Deltametrina, Cipermetrina y Azametifos.. Magister en Bioquímica y Bioinformática. Universidad de Concepción.
2. Waleska Maldonado Aguayo. Análisis transcriptómico del secretoma/excretoma (SE) de piojo de mar Caligus rogercresseyi. Magister en Bioquímica y Bioinformática. Universidad de Concepción.
3. Jacqueline Chávez Mardones. Secuenciación masiva de transcriptoma del piojo de mar caligus rogercresseyi expuestos a antiparasitarios utilizados en la acuicultura. Magister en Bioquímica y Bioinformática. Universidad de Concepción
4. Kennia Morales Collío. Caracterización molecular e identificación de polimorfismos de único nucleótido (SNP) en el gen Miostatina en ostión del Norte Argopecten purpuratus. Magíster en Genética, Universidad Austral de Chile.
5. Sabrina Marin. Caracterización de marcadores moleculares asociados a crecimiento en abalón rojo, Haliotis rufescens. Doctorado en Acuicultura, Universidad Católica del Norte.
6. Gabriel Amar Basulto . Caracterización citogenética molecular de híbridos interespecíficos entre abalón rojo (Haliotis rufescens) y abalón verde (Haliotis discus hannai). Doctorado en Acuicultura, Universidad de Chile.
7. Fabiola Lafarga de la Cruz. Caracterización fenotípica y genética de híbridos inter-específicos entre abalón rojo (Haliotis rufescens) y abalón verde (H. discus hannai). Doctorado en Acuicultura, Universidad de Chile.
8. Valentina Valenzuela Muñoz. Análisis de transcriptoma en tejido reproductivo mediante secuenciación masiva: abalón rojo (Haliotis rufescens) como modelo de estudio. Magister en Bioquímica y Bioinformática. Universidad de Concepción.Dirección de Tesis de Pregrado
9. Camila Riquelme Vidal. Efecto de ferritina recombinante de Caligus rogercresseyi sobre la modulación del metabolismo de hierro y sistema inmune en el salmón atlántico. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
10. Nicole Castillo Villagrán, Evaluación de la respuesta inmune innata del Mytilus chilensis en condiciones experimentales de Acidificación del Océano. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
11. Fredy Vera Bizama. Diferencias en la modulación transcriptómica de caligus rogercresseyi durante la infección en Salmo salar y Oncorhynchus kisutch. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
12. Jorge Aedo. Análisis de la expresión global de genes asociados a crecimiento muscular en congrio colorado (Genypterus chilensis) bajo respuesta a estrés por manejo”. Bioquímica y Magister en Bioquímica, Universidad Nacional Andrés Bello.
13. Ornella Chovar. Evaluación del colágeno IV, Lectina tipo c y Metaloproteasa en la respuesta inmune innata del abalón rojo Haliotis rufescens. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
14. Camila Vallejos C. Modulación de la vía de señalización de insulina mediante perlustrin sintético en Haliotis rufescens. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
15. Diego Valenzuela M. Caracterización de la respuesta inmunogenómica en hemocitos de Argopecten purpuratus (lamarck 1819) en respuesta a una inyección con saxitoxina. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
16. Juan Carlos Retamal A. Caracterización molecular de receptores tipo Toll (TLRs) y evaluación de sus niveles de expresión génica en el urocordado Pyura chilensis expuesto a Alexandrium catenella y vibrio anguillarum. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
17. Daniel Uribe A. Identificación y caracterización de SNPs asociados al crecimiento en abalón rojo Haliotis rufescens. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
18. Jacqueline Chávez M. Caracterización de ferritina e identificación de polimorfismo de único nucleótido (SNP) asociado a respuesta inmune innata de Concholepas concholepas. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
19. Waleska Maldonado A. Caracterización parcial del ARNm del inhibidor de serin proteasa- tipo KAZAL en Mesodesma donacium (Lamarck 1818) y patrones de expresión en respuesta a Vibrio anguilarum. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
20. Pamela Alarcón M. Caracterización del gen del receptor de Insulin-like y análisis de su expresión génica en Mesodesma donacium (Lamarck, 1818). Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
21. Germain Gutierrez S. Evaluación de expresión de Lustrin a, Ferritina y Ornitina decarboxilasa asociados a crecimiento en abalón rojo (Haliotis rufescens). Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
22. Andrea Aguilar E. Caracterización de marcadores EST-SSR en H. rufescens desde secuencias heterólogas. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
23. Paola Rivas N. Caracterización molecular y patrones de expresión del gen miostatina en el ostión del norte Argopecten purpuratus. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
24. Alejandro Castillo R. Análisis de expresión de catalasa y superoxido dismutasa en Haliotis rufescens expuestos a estrés térmico. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
25. Edgardo Castillo E. Inducción a triploidia en abalón rojo (Haliotis rufescens) mediante 6-DMAP. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
26. Diego Forttes G. Construcción de un vector de expresión génica y transfección en espermatozoides de Haliotis rufescens. Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
27. Gustavo Nuñez Acuña. Caracterización del ARNm de HSP70 en abalón rojo (Haliotis rufescens) y análisis de sus niveles de expresión en híbridos de abalón (H. rufescens x H. discus hannai). Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
28. Karina Salinas C. Caracterización y análisis de expresión de Ferritina en abalón rojo (Haliotis rufescens). Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
29. Alejandro Gutierrez. Análisis de expresión de genes involucrados en la diferencia sexual en abalón rojo (Haliotis rufescens). Ingeniería en Biotecnología Marina, UdeC.
30. Silvia Rojas. Caracterización molecular de bacterias asociadas al tracto digestivo en abalón rojo (Haliotis rufescens). Ingeniería en Biotecnología Marina. UdeC.
31. Cindy Costa. Análisis de estructuración genética poblacional de abalón rojo, Haliotis rufescens, mediante marcadores PCR-ISSR. Biólogo Marino, Universidad de Valparaíso.
32. Pamela Prieto. Relaciones filogenéticas del género Fissurella (Mollusca: Vestigastropoda) en las costas de Chile mediante análisis ADNr 16s y región ITS. Biólogo Marino, UdeC.
33. Myriam Valenzuela. Caracterización molecular de genes ribosomales 5S Choromytilus chorus. Biólogo Marino, UdeC.
34. 2007.
35. Felipe Aguilera. Utilización de marcadores de ADN para trazabilidad genética de moluscos gastrópodos de importancia comercial en Chile. Biólogo Marino, Universidad de Valparaíso.
36. Carolina Perone. Genotipificación de parentales y progenie interespecífica entre abalón rojo (Haliotis rufescens) y abalón japonés (Haliotis discus hannai), a través de marcadores microsatélites. Ingeniero Civil en Biotecnología. Universidad San Sebastián.
37. Carolina D’Ottone. Aislamiento de la proteína espermática Lisina involucrada en la fecundación de abalón rojo (Haliotis rufescens). Ingeniero Civil en Biotecnología, Universidad San Sebastián.
38. Jacob Goldstein. Análisis citogenético en el chorito Semimytilus algosus (Bivalvia: Mytilidae): estimación de tamaño genómico y relación cromosómica con otros mitílidos en Chile. Biólogo Marino, Universidad Católica del Norte.
39. Jousepth Gallardo. Inducción a triploidía de meiosis I en el ostión del Norte Argopecten purpuratus (LAMARCK, 1819) mediante 6-DMAP. Biólogo Marino, UCN, 2006.
40. Ángelo Navarro Cortes. Identificación digital de anfípodos del género Hyalella mediante correlaci
Proyectos
1. 2018-2021 FONDECYT N° 1180867. Beyond proteins, genes and mutations: the hidden non-coding nature of the drug resistance in sea lice. Director.
2. 2017-2020 FONDECYT Nº1161512. Inner-shelf regimes of hypoxia in an upwelling region: spatial heterogeneity and implications for coastal benthic ecology. Investigador Principal.
3. 2017-2019 Proyecto Postdoctorado FONDECYT 3170152.Evaluación de factores de riesgo y determinantes de infestación por Caligus rogercresseyi. Evaluación de eficacia de tratamientos antiparasitarios. Dr. Cristian Gallardo, Investigador Principal.
4. 2017-2019 Proyecto FONDEF IDeA dos Etapas. Utilización de extracto de Olivo rico en hidroxitirosol como aditivo en la alimentación de Seriola lalandi. Co- Investigador Principal.
5. 2017-2019 FIE 2015-V014-SERNAPESCA. CaligusLIFE: Scientific research of excellence for the understanding of the biology of Caligus rogercresseyi and its application in caligidosis control strategies in the salmon industry. Director.
6. 2017-2018 Contrato Tecnológico 17COTE-72396. Farmacología en Aquacultura Veterinaria FAV S.A. y Universidad de Concepción. Investigador Principal.
7. 2017 FONDECYT ID16I10453. Utilization of Olive extract rich in hydroxytyrosol as an additive in the diet of Seriola lalandi. Investigador Principal.
8. 2015-2018 Proyecto FONDECYT N° 1150585. Some like it hot: the impact of thermal choice on disease susceptibility in fish. Dr. Sebastian Boltaña (Investigador Principal.), co-Investigador Principal.
9. 2015-2018 FONDECYT N° 1150077. Uncovering the role of microRNAs by deep sequencing during the ontogenetic development of the salmon louse Caligus rogercresseyi. Investigador Principal.
10. 2015-2018 Programa para la Gestión Sanitaria en Acuicultura, FIE 2015-V014. Laboratorio Referencia Caligus – SERNAPESCA, Chile. Investigador Principal.
11. 2014-2018 Proyecto FONDECYT N°1140862. Disentangling source-sink dynamics with spatial and temporal patterns of genomic diversity and structure in Mytilus chilensis and Pyura chilensis. Universidad Católica del Norte, Dra. Pilar Haye, Investigadora Principal.). Investigador Principal.
12. 2014-2017 FONDECYT_Postdoc 3140183-PostDoc Ana Goncalves. Metatranscriptome modulation of pre-and probiotic dietary supplementation in rainbow trout (oncorhynchus mykiss) under intensive aquaculture conditions. Patrocinador.
13. 2014-2016 Proyecto FONDECYT N°3140257. Metatranscriptome modulation of pre- and probiotic dietary supplementation in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) under intensive aquaculture conditions. (Dr. Ana Teresa Gonçalves, Investigadora Principal.), Investigador Principal.
14. 2013-2016 Proyecto FONDECYT N°1130807. Molecular evolutionary underpinnings of a successful invasion: neutral and adaptive divergence and their causes among naturalized rainbow trout populations in two patagonian lakes differentially impacted by aquaculture. (Dr. Daniel Gómez, Investigador Principal.), Investigador Principal.
15. 2013-2016 Proyecto FONDECYT N°. Population genetic structure of the monogenean parasites, Benedenia cf seriolae and Zeuxapta cf seriolae, infesting natural populations of Seriola lalandi, and its implications for aquaculture. (Dr. María Teresa González, Investigadora Principal.), Investigador Principal.
16. 2013-2015 Proyecto Postdoctorado FONDECYT 3130446 “Patrones de expresión de miRNA e identificación de SNPs asociados al proceso de maduración gonadal en la trucha arcoiris Oncorhynchus mykiss” (Dr. Rodolfo Farlora, Investigador Principal.), Investigador Principal.
17. 2013-2015 Proyecto Postdoctorado FONDECYT 3130446 “Patrones de expresión de miRNA e identificación de SNPs asociados al proceso de maduración gonadal en la trucha arcoiris Oncorhynchus mykiss” (Dr. Rodolfo Farlora, Investigador Principal), Investigador Principal.
18. 2012-2017 Proyecto FONDAP Nº1510027. Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), Fourth National Competition for research Centers of Excellence in priority Areas. Director Adjunto.
19. 2012-2017 Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), Fourth National Competition for research Centers of Excellence in priority Areas, FONDAP 2011. Director Adjunto.
20. 2012-2015 Proyecto 12IDL2-15119 I+D Aplicada InnovaChile Corfo “Generación de vacuna inhibitoria de Miostatina para incrementar el crecimiento de abalones rojo, como estrategia de mejoramiento productivo”. Director.
21. 2012-2015 Proyecto 12IDL2-15119 I+D Aplicada Innova Chile Corfo “Generación de vacuna inhibitoria de Miostatina para incrementar el crecimiento de abalones rojo, como estrategia de mejoramiento productivo”. Director.
22. 2012-2014 Proyecto FONDECYT 1120896. “Latitudinal shift in the coupling of inner-shelf and mesoscale variability as an explanation for the ecological break observed along central-northern Chile (30-31°S). Universidad de Concepción. (Dr. Fabian Tapia, Investigador Principal), Co- Investigador Principal.PI.
23. 2012-2014 Proyecto FONDECYT 1120397. “Insights into innate immune response of bivalves challenged to Alexandrum catenella: Comparative transcriptome analysis by 454 pyrosequencing”. Universidad de Concepción. Investigador Principal.
24. 2011-2014 Proyecto FONDEF D09I1067. “Biotecnología aplicada a la producción de un híbrido entre abalón rojo y verde (Fase 2): Optimización del procedimiento de cruza para el desarrollo de una variedad de interés productivo y comercial”. Universidad de Concepción. Director.
25. 2011-2014 FONDEF D09I1065. “Plataforma de referencia para el manejo genómico sustentable de recursos bentónicos de interés comercial y repoblamiento de bancos naturales”. Universidad de Concepción, Universidad Católica del Norte, Universidad Austral de Chile. Co- Investigador Principal.
26. 2010-2012 Proyecto “Desarrollo y validación de una técnica innovadora de identificación parental genética en loco Concholepas concholepas como herramienta para evaluar la efectividad de las metodología s de repoblamiento, acondicionamiento y manejo en las AMERBs de la IV Región”. GORE- Coquimbo. Chile. Director.
27. 2008-2011 Director General Proyecto INNOVA 07CT9 PDT-79. “Trazabilidad genética de productos acuícolas: Desarrollo de un banco de información genética para la industria alimentaria de exportación”. Universidad de Concepción-Chile, Universidad Católica del Norte. Director.
28. 2008-2011 Director General Proyecto FONDEF D06I1085. “Producción de abalones monosexo mediante inactivación nuclear gamética y desarrollo de una técnica para la identificación sexual: soluciones biotecnológicas para la industria del abalón”. Universidad de Concepción-Chile. Dr. Cristian Gallardo (Director General). (M$197.000 CLP).
29. 2008-2009 Investigador Asociado al proyecto FIP 2008-39 “Caracterización molecular de los principales recursos bentónicos y estudio de conectividad entre sus poblaciones entre la I y II Regiones. (FaseI). Investigador Principal.
30. 2007-2010 Director General Proyecto FONDEF D06I1027. “Biotecnología aplicada a la producción de un híbrido entre abalón rojo y verde: desarrollo de un nuevo producto y prospección del mercado consumidor”. Universidad de Concepción-Chile, Universidad Católica del Norte. Director.
31. 2006-2009 Investigador asociado Proyecto FONDEF D05I10258. “Producción a escala piloto de hembras de choro zapato con color gonadal modificado mediante técnicas biotecnológicas”. Universidad de Concepción, Universidad Católica del Norte-Chile. Investigador Principal.
32. 2006-2009 Director Alterno Proyecto FONDEF D05I10246. “Investigación y desarrollo de un banco de germoplasma criobiotecnológico para especies marinas”. Universidad Católica del Norte-Chile, Universidad de Valparaíso. Director Adjunto.
33. 2002-2005 Investigador Asociado FONDEF D02I1095. “Optimización de la producción ambientalmente limpia de triploides de ostión del norte Argopecten purpuratus”. Universidad Católica del Norte, Coquimbo – Chile. Asistente de Investigación.
34. 2002-2004 Proyecto CONICYT 36075-b. “Procesamiento Automático de Partículas Biogénicas”. Centro de Investigación Científica y de Educación superior de Ensenada, México. Asistente de Investigación
35. 2002-2004 Proyecto CONICYT 33018-b. “Marcadores genéticos en el abalón Haliotis spp.”. Asistente de Investigación