Los resultados del estudio \u201cMultilocus sequence typing detects new Piscirickettsia salmonis<\/em> hybrid genogroup in Chilean fish farms: Evidence for genetic diversity and population structure\u201d, liderado por el Estudiante de Doctorado de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n \u201cSalud Animal en Ambiente Marino\u201d (RP3), del INCAR, Adolfo Isla, fue publicado por el Journal Fish Diseases vol. 42 del mes de abril, realizando una significativa contribuci\u00f3n a la comprensi\u00f3n de este pat\u00f3geno, causante de la enfermedad m\u00e1s mortal en los centros de cultivo chilenos.
La investigaci\u00f3n que tuvo por objeto desarrollar un m\u00e9todo que complemente o reemplace a otras formas de tipificaci\u00f3n para determinar la diversidad gen\u00e9tica y\/o las relaciones filogen\u00e9ticas de los distintos aislados de P. salmonis<\/em>, descubri\u00f3 que siete aislados de los cuarenta y dos analizados no clasificaban en de los genogrupos LF-89 y EM-90, sino que dentro de otro genogrupo \u201ch\u00edbrido\u201d, cuyo origen no se pudo determinar en el estudio. Tres de estos aislados fueron recolectados de trucha arco\u00edris y cuatro de salm\u00f3n Atl\u00e1ntico. Adem\u00e1s, se detect\u00f3 la presencia de otros dos grupos similares a los conocidos LF-89 y EM-90, pero no id\u00e9nticos.
Para el estudio se recolectaron 42 aislados bacterianos de las regiones de Los Lagos y Ays\u00e9n, de las tres especies salmon\u00eddeas cultivadas en Chile, y se analizaron las secuencias de siete genes (dnaK, efp, fumC, glyA, murG, rpoD y trpB) mediante la tecnica de tipificaci\u00f3n multilocus de secuencias (MLST por sus siglas en ingl\u00e9s).
\u201cCuando decidimos realizar este estudio siempre tuvimos en consideraci\u00f3n que el protocolo y secuencia de los genes del MLST se deb\u00eda validar cient\u00edficamente y dejarlo disponible a toda la comunidad. Por tanto, hoy se puede implementar en las universidades, laboratorios de diagn\u00f3sticos, empresas salmoneras, incluso en entidades gubernamentales y esto traer\u00e1 como consecuencia un enriquecimiento de los datos epidemiol\u00f3gicos\u201d, explic\u00f3 el Investigador Principal de la l\u00ednea de Investigaci\u00f3n \u201cSalud Animal en estados de vida de agua dulce de peces nativos y salm\u00f3nidos\u201d (RP2), del Centro Interdisciplinario para la Investigaci\u00f3n Acu\u00edcola, INCAR, Dr. Ruben Avenda\u00f1o-Herrera.
Los pr\u00f3ximos pasos de la investigaci\u00f3n se enfocar\u00e1n en generar un nuevo kit diagn\u00f3stico que permita discriminar entre los genogrupos LF-89 y EM-90 y posteriormente, que tambi\u00e9n permita el reconocimiento de alg\u00fan genogrupo h\u00edbrido que se logre identificar y analizar los nuevos genomas que est\u00e1n disponibles en la base de datos del Centro Nacional para la Informaci\u00f3n Biotecnol\u00f3gica (NCBI por sus siglas en ingl\u00e9s) para buscar genes \u00fanicos de las distintas cepas h\u00edbridas.
En el estudio publicado en la Journal Fish Diseases participan los investigadores INCAR: Adolfo Isla, Denisse Haussmann, Jaime Figueroa, Ruben Avenda\u00f1o\u2013Herrera y Alejandro Ya\u00f1ez, junto a M\u00f3nica Saldarriaga\u2010C\u00f3rdoba (Centro de Investigaci\u00f3n en Recursos Naturales y Sustentabilidad, Universidad Bernardo O’Higgins), Derie E. Fuentes (Fraunhofer Chile Research Foundation, Center for Systems Biotechnology), Romina Albornoz (Departamento de Ciencias B\u00e1sicas, Facultad de Ciencias, Universidad Santo Tom\u00e1s de Valdivia), Jorge Mancilla\u2010Schulz (Mowi Chile S.A.) y Alexis Mart\u00ednez (Laboratorio Antares S.A).
Revisa el estudio aqu\u00ed<\/a>.<\/p>\n\n\n\n
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