{"id":5923,"date":"2020-06-02T16:23:43","date_gmt":"2020-06-02T16:23:43","guid":{"rendered":"https:\/\/www.incar.cl\/?p=5923"},"modified":"2020-06-05T14:26:40","modified_gmt":"2020-06-05T18:26:40","slug":"5923-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/centroincar.cl\/en\/2020\/06\/02\/5923-2\/","title":{"rendered":"Nuevo Policy Brief del Centro INCAR aborda descripci\u00f3n del genoma del C. rogercresseyi"},"content":{"rendered":"

El Programa Integrativo del Centro Interdisciplinario para la Investigaci\u00f3n Acu\u00edcola, INCAR, public\u00f3 un nuevo Policy Brief, iniciativa que consiste en traducir los principales hitos de investigaci\u00f3n del centro en res\u00famenes en espa\u00f1ol con recomendaciones desde la ciencia para pol\u00edticas p\u00fablicas.
\nEl texto, denominado \u201cDescifrando el genoma del piojo del salm\u00f3n Caligus rogercresseyi, para un control efectivo y sustentable\u201d, forma parte de uno de los principales hitos del Centro a nivel nacional e internacional, pues se trata de la descripci\u00f3n por primera vez del genoma de C. rogercresseyi a escala cromos\u00f3mica, obtenido mediante la utilizaci\u00f3n de las \u00faltimas tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n. Adicionalmente, como resultado de la secuenciaci\u00f3n del genoma de Caligus fue posible la identificaci\u00f3n de las comunidades bacterianas asociadas a este ectopar\u00e1sito.<\/p>\n

Contexto, alcances y objetivo<\/h3>\n

Caligus rogercresseyi es el ectopar\u00e1sito que actualmente genera mayor impacto econ\u00f3mico y riesgo sanitario en la industria del salm\u00f3n en Chile. Los da\u00f1os econ\u00f3micos provocados est\u00e1n relacionados directamente con la p\u00e9rdida de calidad del producto final, crecimiento retardado de los peces parasitados e incremento de la susceptibilidad frente a otros pat\u00f3genos. Esto sumado a los costos generados por los tratamientos, que, seg\u00fan cifras aportadas por el Instituto tecnol\u00f3gico del Salm\u00f3n, INTESAL, son de aproximadamente 480 millones de d\u00f3lares al a\u00f1os.<\/p>\n

Para el control la caligidosis, desde sus inicios la industria salmonera a nivel mundial ha privilegiado el uso de antiparasitarios. Estos f\u00e1rmacos afectan el sistema nervioso del piojo. Sin embargo, el uso prolongado de \u00e9stos genera p\u00e9rdida de la sensibilidad farmacol\u00f3gica y en consecuencia la aparici\u00f3n de poblaciones resistentes. El fen\u00f3meno observado de baja sensibilidad de C. rogercresseyi a los antiparasitarios ha provocado, que desde el a\u00f1o 2007 la autoridad haya reaccionado y puesto mayor \u00e9nfasis en el control de la enfermedad.<\/p>\n

De manera de contribuir con nuevas estrategias para el control de la caligidosis, en los \u00faltimos a\u00f1os grupo de investigadores de la l\u00ednea \u201cGen\u00f3mica Acu\u00edcola\u201d del Centro INCAR liderado por el Dr. Cristian Gallardo-Esc\u00e1rate ha generado gran cantidad de informaci\u00f3n transcript\u00f3mica de los distintos estados de desarrollo de C. rogercresseyi. Estos estudios transcript\u00f3micos han permitido identificar genes involucrados en procesos biol\u00f3gicos de importancia para el par\u00e1sito como: su desarrollo larval, reconocimiento de hospedero, maduraci\u00f3n sexual, metabolismo, entre otros. Durante el 2018 el grupo de investigadores de la RP1 del Centro INCAR en conjunto con el Programa para la Gesti\u00f3n Sanitaria en la Acuicultura (FIE-2015-V014), se propusieron obtener el primer genoma de referencia para C. rogercresseyi.
\n\u201cCon la obtenci\u00f3n del genoma de Caligus se busca incrementar la informaci\u00f3n gen\u00e9tica del ectopar\u00e1sito, caracterizar y localizar genes ligados al desarrollo del ectopar\u00e1sito, asi como conocer los mecanismos moleculares involucrados en la respuesta a antiparasitarios. Adem\u00e1s de abrir la oportunidad de identificar nuevas mol\u00e9culas con potencial antig\u00e9nico para el desarrollo de vacunas, como m\u00e9todo alternativo para el control de enfermedades como la caligidosis\u201d, explica sobre la investigaci\u00f3n, el Investigador Principal de la l\u00ednea \u201cGen\u00f3mica Acu\u00edcola\u201d, del Centro INCAR, Dr. Cristian Gallardo-Esc\u00e1rate.<\/p>\n

El genoma de C. rogercresseyi abre la posibilidad de estudiar a fondo procesos importantes asociados a la enfermedad. Como ejemplo, es posible comprender los procesos asociados a la resistencia de farmacol\u00f3gica. Desarrollar biomarcadores para la evaluaci\u00f3n de sensibilidad farmacol\u00f3gica de las distintas poblaciones de Caligus. Adem\u00e1s, el genoma de Caligus permite el desarrollo de nuevos m\u00e9todos de control del ectopar\u00e1sito. Por ejemplo, la identificaci\u00f3n de potenciales ant\u00edgenos, que pusiesen ser utilizados para el desarrollo de vacunas contra el ectopar\u00e1sito.<\/p>\n

\u201cEs de gran importancia incrementar las medidas de vigilancia y control de C. rogercresseyi en la industria salmonicultora, no s\u00f3lo por las p\u00e9rdidas que ocasiona directamente en el cultivo de salm\u00f3n. Si no por que adem\u00e1s, Caligus pudiese actuar como reservorio de bacterias potencialmente pat\u00f3genas, afectando la productividad de la industria salmonera\u201d, concluye el documento.
\nRevisa y descarga el Policy Brief aqu\u00ed<\/a><\/p>\n

\"\"

Figura 1. Genoma de Caligus rogercresseyi. Grafica circus muestra los 21 seudo-cromosomas identificados. A) contenido GC; B) densidad de genes; C) densidad de lncRNAs; D) densidad de miRNAs; E) elementos repetitivos.<\/p><\/div>\n

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