Una investigación colaborativa entre académicos de la Pontificia Universidad Católica de Chile, Universidad Andrés Bello (UNAB), Universidad Católica del Maule, del Centro de Investigación Marina de Quintay (CIMARQ) y del Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola (INCAR), generó el primer ensamblaje de novo del transcriptoma hepático del Congrio negro (Genypterus maculatus).
“Se ensambló el transcriptoma de novo, logrando identificar 26,620 transcritos, conbuena calidad(N50 de 2297). El análisis realizado con BUSCO indicó una recuperación del 97,1% de los genes esperados para metazoos y del 75,7% para peces óseos, lo que sugiere un ensamblaje transcriptómico de alta integridad. Por otro lado, el análisis de expresión génica reveló 94 transcritos diferencialmente expresados en respuesta al estrés térmico: 64 presentaron una disminución y 30 un aumento en su expresión. Estos transcritos representan candidatos prometedores como biomarcadores para evaluar el impacto del estrés térmico en esta especie””, explicó el Académico de la UNAB e Investigador Asociado de la línea»Salud animal en estadios tempranos de salmónidos y recursos nativos», del Centro INCAR, Dr. Juan Antonio Valdés.
El ensamblaje de novo de un transcriptoma es el proceso de reconstruir secuencias de ARN mensajero (transcritos) a partir de lecturas de secuenciación sin usar un genoma de referencia. Se basa en algoritmos que agrupan y ensamblan fragmentos solapantes para formar transcritos completos. Es fundamental en organismos no modelo o sin genoma disponible, como el Congrio negro.
Debido a que el hígado cumple un rol fisiológico muy relevante como la desintoxicación de compuestos, el metabolismo de nutrientes y la síntesis de proteínas plasmáticas. También participa en el almacenamiento de energía, principalmente en forma de glucógeno y lípidos, y actúa como un órgano inmunológico clave frente a infecciones y estrés ambiental, los investigadores determinaron el efecto del estrés térmico en el hígado del Congrio negro bajo una ola de calor, evidenciando que este aumento de temperatura podría generar estrés en los peces, generando daño oxidativo y afectando el sistema de reparación del ADN. Además, esta respuesta al estrés térmico podría variar entre las especies del género Genypterus, información a considerar en el desarrollo de la industria acuícola del Congrio.
La genómica en la acuicultura
El enfoque genómico acelera el conocimiento molecular en especies acuícolas no tradicionales, permitiendo identificar rápidamente genes asociados a rasgos clave como crecimiento, resistencia y adaptación. Así, impulsa la diversificación de la acuicultura y reduce la dependencia de especies como salmónidos.
Las herramientas transcriptómicas como RNA-seq permiten entender cómo responden molecularmente los peces a factores como enfermedades, estrés u otras variables productivas. Esto ayuda a diseñar estrategias más precisas y sostenibles, por ejemplo, identificar biomarcadores, para mejorar la salud, el bienestar y el rendimiento productivo en acuicultura.
Revisa el paper “Generating transcriptomic resources in the teleost fish black cusk‑eel (Genypterus maculatus) to evaluate thermal stress in the liver under a climate change scenario”, de los investigadores Dr. Phillip Dettleff, Marcia Fuentes, Pamela González, Dr. Jorge Aedo, Dr. Rodrigo Zuloaga, Dr. Juan Manuel Estrada, Dr. Alfredo Molina y Dr. Juan Antonio Valdés.https://doi.org/10.1007/s10695-025-01486-y
