Dr. Ruben Avendaño Herrera Principal Investigator RP2: Animal Health in Early Life Stages of Salmonids and Native Resources
Principal Investigator RP2: Animal Health in Early Life Stages of Salmonids and Native Resources
Biography
Dr. Ruben Avendaño-Herrera is an Aquaculture Engineer with a bachelor’s in marine sciences from Universidad de Antofagasta (1997). He holds a Ph.D. in Biology from the Microbiology and Parasitology program at the University of Santiago de Compostela, Spain (2005), and a Post-Doctorate from the Universidad Andrés Bello (2010-2013). From 2006 to 2009, Dr. Rubén Avendaño-Herrera worked as a researcher at the pharmaceutical company Veterquímica Ltda., and in 2010, he joined to Universidad Andrés Bello (UNAB). Currently, he is a Full Professor and director of the Laboratory of Pathology of Aquatic Organisms and Aquaculture Biotechnology at UNAB. He is also the Principal Investigator at INCAR.
Dr. Ruben Avendaño-Herrera main research topics include aquaculture pathology, aquatic organisms’ diseases, biotechnological tools applied to aquaculture, standardization of procedures to control and validate the appropriate use of antibiotics, and the development of vaccines against aquatic pathologies. He has authored over 120 articles (mainly indexed by WoS) and 7 book chapters, including one book on infectious diseases in salmon farming in Chile and worldwide. He is also referee for more than 30 international journals and member of the editorial board of Journal of Fish Disease.
Dr. Ruben Avendaño-Herrera has participated in 29 projects (national and international), 17 of them as principal investigator. He has supervised 11 doctoral theses, sponsored postdoctoral researchers, has participated as a committee member for 25 undergraduate theses. He has been part of the Animal Health and Production Committee of FONDECYT and served as its president and is currently a member of the Fisheries and Aquaculture Committee of FONDEF. He is also a member of various evaluation committees for different funds/grants from ANID and a member of the Aquaculture Working Group of CLSI.
Academic Titles and Degrees
2005 Doctor en Biología, Universidad de Santiago de Compostela, España.
1997 Ingeniero en Acuicultura, Universidad de Antofagasta, Chile.
1997 Licenciado en Ciencias del Mar, Universidad de Antofagasta, Chile.
Latest Publications
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Medina-Morillo, M., Irgang, R., & Yunis-Aguinaga, J., Avendaño-Herrera, R. (2024). Antimicrobial susceptibility of Peruvian Yersinia ruckeri isolates to oxytetracycline and florfenicol using MIC testing. Diseases of Aquatic Organisms, 159, 127-131.
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Avendaño-Herrera, R., Saldarriga-Córdoba, M., Poblete-Morales, M., & Irgang, R. (2024). Flavobacterium psychraquaticum sp. nov., isolated from water system of Atlantic salmon (Salmo salar) smolts cultured in Chile. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 74(4), 6309-6319.
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Avendaño-Herrera, R., Echeverría-Bugueño, M., Hernández, M., Saldivia, P., & Irgang, R. (2024). Proteomic characterization of Tenacibaculum dicentrarchi under iron limitation reveals an upregulation of proteins related to iron oxidation and reduction metabolism, iron uptake systems and gliding motility. Journal of Fish Diseases, 47(9), e13984-13997.
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Levipan, H., Wicki, H., Barrias-Henriquez, F., & Avendaño Herra, R. (2024). Estudio de la piel mucosa de la trucha arco iris (Oncorhynchus mykiss) como barrera contra piscirickettsiosis: un escenario de transmisión por agua en ausencia de vectores. Versión Diferente, 1, 44-47.
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Avendaño-Herrera R, Godoy MG, Heisinger A, Fernández J. 2010. Identification and characterization of Flavobacterium columnare associated with mortality of salmonids farmed in Chile. III International Aquaculture Congress. 23-26 de noviembre, Viña del Mar, Chile.
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Godoy M., Kibenge F., Gherardelli V., Olmos P., Ovalle L., Muñoz G., Kibenge M., Wang Y., Gallardo A., Lara M., Avendaño-Herrera R. 2010. Virulence markers in Haemagglutinin-esterase (HE) protein (Highly Polymorphic Region) and Fusion Protein (Q266-L266) in infectious salmon anaemia virus (ISAV) in Chile. International Symposium on Infectious Salmon Anaemia (ISA-OIE). 13-15 de septiembre, Oslo, Noruega.
Avendaño-Herrera R., Balboa S., Contreras-González A., Magariños B., Fernández J., Toranzo A.E., Romalde J.L. 2010. Estudio comparativo de cepas de Streptococcus phocae aisladas de salmón y foca. VIII Reunión de Microbiología Del Medio Acuático. 14 a 16 de septiembre, Vigo, España.
Avendaño-Herrera R. 2009. Significance of Flavobacterium diseases on salmonid farming in Chile. Flavobacterium 2009. 21-23 de septiembre, Paris, Francia.
Avendaño-Herrera R., Ilardi P., Fernandez J. 2009. Significance of Flavobacterium diseases on salmonid farming in Chile. 21-23 de septiembre, Paris, Francia.
Avendaño-Herrera R., Balboa S., Doce A., Ilardi P, Lovera P., Toranzo A.E., Romalde J.L. 2009. Pseudo-membranes on internal organs associated with Rhodococcus infection in Atlantic salmon (Salmo salar) cultured in Chile. 14th EAFP International Conference of Diseases of Fish and Shellfish. Praga, República Checa.
Avendaño-Herrera R. 2008: International Conference on Fish Diseases and Fish Immunology. 6 - 9 de septembre. Reykjavik, Islandia.
Guided Thesis
Tesis de Postgrado
1. Sebastian Lagos Donoso. 2013. Ingeniero en Acuicultura y Magister en Acuicultura (Universidad Andrés Bello). Título: “Estudio de la adición de pigmentos carotenoides en la pigmentación de la piel y parámetros productivos de ejemplares de cabrilla, Sebastes oculatus, mantenidos en cautiverio”.
2. Hernán Henríquez-Núñez. 2012. Ingeniero en Acuicultura y Magíster en Acuicultura (Universidad Andrés Bello). Título: “Estudio de la susceptibilidad a antimicrobianos de cepas chilenas de Flavobacterium psychrophilum y Vibrio ordalii aisladas de salmónidos cultivados”.
3. Alberto González Contreras. 2010. Ingeniero en Acuicultura y Magister en Acuicultura (Universidad Andrés Bello). Título: “Estudio de las propiedades de superficie asociadas a la virulencia en el patógeno de salmón del Atlántico (Salmo salar) cultivado en Chile, Streptococcus phocae”.
4. Jessica Abad Hernández. 2008. Ingeniero en Acuicultura y Magister en Acuicultura (Universidad Andrés Bello). Título: “Evaluación de la eficacia del producto Plasmicel sobre el patógeno de salmón del Atlántico (Salmo salar) Flavobacterium psychrophilum”.
5. Pedro Ilardi Lazcano. 2008. Biólogo Marino y Magister en Biología Marina (Universidad Andrés Bello). Título: “Identificación, caracterización y patogenicidad de bacterias de la familia Flavobacteriaceae patógenos oportunistas en el cultivo de salmónidos”. 60 p.
Tesis de Pregrado
1. Oscar Evrard Arrue. 2013. Universidad Andrés Bello. Título: “Análisis proteico del patógeno acuícola Flavobacterium psychrophilum cultivado en condiciones restrictivas de hierro”.
2. Matias Poblete Morales. 2012. Licenciado en Biología y Titulo Profesional Biólogo (Pontifica Universidad Católica de Valparaiso). Título: “Aislamiento y caracterización de bacteriófagos contra el patógeno acuícola Aeromonas salmonicida atípicas”.
3. Berenice Andrea Gillibrand Pedraza. 2008. Ingeniero en Acuicultura (Universidad Andrés Bello). Título: “Analisis y selección de prebióticos y probióticos en larvas de peces marinos”.
4. Andrés Alejandro Silva Rubio. 2007. Bioquímico (Universidad de Chile). Título: “Caracterización molecular y serológica de agentes causales de vibriosis en salmónidos en el sur de Chile”.
Projects
2024-2026. Anticipating instead of reacting to the imminent threat of bacterial co-infections in farmed salmon in Chile: elucidation of fish susceptibility, bacterial behavior, and treatment efficacies during a dual or multiple co-infection in Atlantic salmon. 1230068. FONDEF. Ruben Esteban Avendaño Herrera.
2021-2024. Production and evaluation of a diagnostic kit and an adjuvanted divalent vaccine against Yersinia ruckeri and Weissella ceti in rainbow trout. 28-2020. Animal Health in Early Life Stages of Salmonids and Native Resources. Ruben Esteban Avendaño Herrera.
2024-2024. Molecular characterization of Lactococcus spp. isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) affected by septicemic disease. UAEM ODS2024. Animal Health in Early Life Stages of Salmonids and Native Resources. Ruben Esteban Avendaño Herrera.
2023-2026 Anticipating instead of reacting to the imminent threat of bacterial co-infections in farmed salmon in Chile: elucidation of fish susceptibility, bacterial behavior, and treatment efficacies during a dual or multiple co-infection in Atlantic salmon. 1230068. FONDECYT. Ruben Esteban Avendaño Herrera, Main Researcher.
2023 -2025 Estudio del rol de las vesículas de membrana de R. salmoninarum crecidas en condiciones limitante de hierro sobre la patogenicidad en ejemplares de salmón del Atlántico (Postdoc Dr. Macarena Echeverría). 3230453. FONDECYT. Ruben Esteban Avendaño Herrera, Postdoc sponsor.
2022-2025. “SNAKE VENOM TOXINS FOR DRUG DISCOVERY: IDENTIFICATION AND EVALUATION OF PROTEINS AND PEPTIDES WITH ANTIMICROBIAL ACTIVITY. 1220921. FONDECYT. Ruben Esteban Avendaño Herrera, Main Researcher.
2024-2024 Caracterización molecular de Lactococcus spp. aisladas de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) afectadas por enfermedad septicémica. UAEM ODS2024, Universidad Autónoma del Estado de México Convocatoria de Proyectos de Investigación Científica para la Consolidación de Grupos de Investigación y los Estudios Avanzados, con Enfoque de Inclusión e Integridad en el Marco de los ODS. Ruben Esteban Avendaño Herrera, Main Researcher
2021-2024 Production and evaluation of a diagnostic kit and an adjuvanted divalent vaccine against Yersinia ruckeri and Weissella ceti in rainbow trout. CONCYTEC Perú 74598 17 2. Ruben Esteban Avendaño Herrera, Main Researcher
2019-2023 FONDECYT 1190283. Comprehensive study of the biological, genetic, and molecular bases and virulence factors for the causative agent of tenacibaculosis in Chilean marine fish, Tenacibaculum dicentrarchi: an epidemiological approximation for developing prevention strategies. Ruben Avendaño, Investigador Principal.
2019-2021 Strengthening of capacities to evaluate the limitations of pink shrimp fishing to Climate Change in coastal areas of Uruguay. Renato Quiñomes, Investigador Principal.
2018-2020 Grant FIE 122929. Grant FIE 122929 “Integral studies on the biological and molecular bases of the life cycle of Piscirickettsia salmonis with epidemiological approach to develop techniques that allow its control. Rúben Avendaño, Director.
2018 Grant SERNAPESCA ID Nº 1697-79-IN18. Analysis for the detection of tenacibaculosis an emerging disease in salmonids: evaluation of sanitary conditions in the field and technical consulting services to SERNAPESCA. Ruben Avendaño, Investigador Principal.
2017-2020 UAEM 2017-2018 Proyecto Nº 4489/2018/CI. International Collaborator on Mexican grant UAEM 2017-2018 4489/2018/CI Biochemical and molecular characterization of Streptococcus spp. obtained from from rainbow trout Oncorhynchus mykiss. Ruben Avendaño, Investigador Principal.
2016-2018 FIE 2015 V014. Program for Sanitary Management in Aquaculture (Programa para la Gestión Sanitaria en la Acuicultura) execution with SERNAPESCA. Responsible entity PUCV). Ruben Avendaño, Investigador Principal
2015-2019 FONDECYT 1150695. Identification and characterization of the iron uptake system in different Chilean Renibacterium salmoninarum isolates and its influence on pathogenesis and inmunogenicity in Atlantic salmon and rainbow trout. Ruben Avendaño-Herrera, Investigador Principal.
2015-2018 FONDECYT Nº 3150505_Postdoc_Hector Levipan Determination of the quorum sensing role on the formation of biofilms of Flavobacterium psychrophilum and Piscirickettsia salmonis: sequestration of ALH type bacterial communication signals as alternative of bacterial control. Rubén Avendaño, Patrocinador.
2013-2017 INACH (RT08-13). Study of bacteria diversity in antarctic waters and fish specie: Search for natural reservoirs of salmonids pathogens. Ruben Avendaño, Director.
2013 - 2015 Proyecto Núcleo 447. Título: “Estudio de mecanismos de virulencia del patógeno acuícola, Flavobacterium psychrophilum, basado en un modelo innovador de cultivo primario de células y larvas de peces”.
2013 - 2015 FIA –PYT-2013-0014. Título: “Base nacional de aislados bacterianos para la industria acuícola: un nuevo servicio para el diagnóstico, tratamiento y prevención de enfermedades de salmónidos”. Coordinador General.
2012 - 2017 FONDAP 15110027. Título: “Centro Interdisciplinário de Investigación en Acuicultura Sustentable (INCAR)”. Investigador Principal
2012 - 2016 Proyecto FONDEF D10I1141. Título: “Desarrollo de la tecnología para el cultivo intensivo del congrio colorado: Fase II engorda”. Investigador Principal.
2012 - 2014 Proyecto Interno Universidad Andrés Bello Nº DI-99-12/R. Título: “Evaluación de la eficacia de vacunas sitio-específicas o autovacunas de inmersión para la prevención de la Flavobacteriosis causada por Flavobacterium psychrophilum en alevines de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss)”. Investigador Responsable.
2011 - 2013 Proyecto FONDECYT REGULAR 1110219. Título: “Study of phage display strategy for the immunization of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) against the Chilean freshwater pathogen Flavobacterium psychrophilum”. Investigador Responsable.
2010 – 2013 Proyecto del Concurso Nacional de Inserción de Nuevos/as Investigadores/as Posdoctorales en la Academia, Centros e Institutos de Investigación Nacionales, Universidad Andrés Bello (CONICYT) No. 79090006. Título: “Fortalecimiento y consolidación de las competencias académicas e investigación científica en el área acuícola asociada al Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad Andrés Bello a través de la inserción de 2 investigadores de excelencia”. Investigador Responsable.
2009 - 2011 Proyecto Interno Universidad Andrés Bello Nº DI-01-10/R. Título: “Estudio de las concentraciones mínima inhibitoria y susceptibilidad in vitro de florfenicol, oxitetraciclina y ácido oxolínico en cepas de patógenos prevalentes de salmónidos, con el fin de estandarizar la selección de tratamientos terapéuticos”. Investigador Responsable.
2009 - 2011 Proyecto FONDECYT REGULAR 1090054: Título: “Estudios in vitro e in vivo de factores de patogenicidad en el patógeno de salmón del Atlántico (Salmo salar) Streptococcus phocae”. Investigador Responsable.
2008 - 2009 Proyecto INNOVA Código Nº 207-6537. Título: “Investigación, desarrollo y producción de vacunas para la prevención de la Pisciricketsiosis y enfermedades infecciosas concomitantes en Salmo salar”. Co-investigador.
2006 - 2009: Proyecto IPC19 de inserción de personal altamente calificado en empresas del sector chileno del Programa de Bicentenario de Ciencia y Tecnología (CONICYT). Título: “Desarrollo y producción de vacunas con registro sanitario para peces, indicadas para prevenir las enfermedades infecciosas producidas por patógenos emergentes aclimatados en Chile”. Investigador Principal en Veterquímica S.A.
2004 - 2005 Proyecto AGL2004-07037 del Ministerio de Ciencia y Tecnología, España. Participación: Miembro del Equipo de Investigación del Proyecto. Universidad de Santiago de Compostela, España. Título: Estudios in vitro e in vivo de importantes factores de virulencia en los patógenos de peces marinos Pseudomonas anguilliseptica y Tenacibaculum maritimum”. Miembro del Equipo Investigador.